Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Ttc39dQ0VF76 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Ttc39dQ0VF76 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Ttc39dQ0VF76 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ttc39dQ0VF76 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ttc39dQ0VF76 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Ttc39dQ0VF76 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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Ttc39dQ0VF76 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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