Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap5bQ0V8T8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap5bQ0V8T8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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