Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms