Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf541Q0GGX2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf541Q0GGX2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms