Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc7a1Q09143 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms