Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff1Q08423 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff1Q08423 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms