Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrstQ06666 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms