Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PSME1Q06323 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSME1Q06323 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms