Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mark3Q03141 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms