Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx1P81068 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms