Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q6P79568 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Q6P79568 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms