Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms