Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtgdrP70263 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PtgdrP70263 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtgdrP70263 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtgdrP70263 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtgdrP70263 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtgdrP70263 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtgdrP70263 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtgdrP70263 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtgdrP70263 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtgdrP70263 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtgdrP70263 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms