Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta1P68134 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta1P68134 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta1P68134 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta1P68134 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms