Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo1P63166 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sumo1P63166 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms