Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrch1P62046 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrch1P62046 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms