Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnnP61807 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SnnP61807 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnnP61807 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnnP61807 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SnnP61807 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnnP61807 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnnP61807 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnnP61807 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnnP61807 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnnP61807 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnnP61807 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnnP61807 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SnnP61807 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnnP61807 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnnP61807 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnnP61807 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnnP61807 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnnP61807 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnnP61807 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnnP61807 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnnP61807 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnnP61807 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnnP61807 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms