Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2kP61087 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms