Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1P56183 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms