Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pex2P55098 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pex2P55098 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pex2P55098 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms