Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Faf1P54731 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Faf1P54731 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Faf1P54731 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms