Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RabggtbP53612 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtbP53612 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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