Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms