Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn1cP49919 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn1cP49919 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms