Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.4 ms