Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NdnP25233 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NdnP25233 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NdnP25233 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NdnP25233 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NdnP25233 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NdnP25233 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NdnP25233 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NdnP25233 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NdnP25233 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NdnP25233 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NdnP25233 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NdnP25233 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms