Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KitlgP20826 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KitlgP20826 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KitlgP20826 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms