Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms