Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sdc1P18828 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms