Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa-rs1P17533 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms