Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna1P16388 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcna1P16388 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms