Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf4P11403 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf4P11403 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms