Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nid1P10493 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nid1P10493 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nid1P10493 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nid1P10493 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nid1P10493 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nid1P10493 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nid1P10493 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms