Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem254aP0DN89 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem254aP0DN89 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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