Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NefmP08553 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NefmP08553 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NefmP08553 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NefmP08553 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NefmP08553 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NefmP08553 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NefmP08553 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NefmP08553 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NefmP08553 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefmP08553 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefmP08553 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefmP08553 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefmP08553 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefmP08553 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefmP08553 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefmP08553 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefmP08553 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefmP08553 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefmP08553 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefmP08553 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefmP08553 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefmP08553 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefmP08553 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefmP08553 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefmP08553 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefmP08553 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefmP08553 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefmP08553 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NefmP08553 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NefmP08553 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NefmP08553 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NefmP08553 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NefmP08553 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NefmP08553 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NefmP08553 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NefmP08553 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NefmP08553 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NefmP08553 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NefmP08553 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NefmP08553 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NefmP08553 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NefmP08553 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NefmP08553 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NefmP08553 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NefmP08553 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NefmP08553 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NefmP08553 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NefmP08553 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NefmP08553 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefmP08553 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefmP08553 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefmP08553 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefmP08553 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefmP08553 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefmP08553 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefmP08553 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefmP08553 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NefmP08553 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NefmP08553 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NefmP08553 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NefmP08553 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NefmP08553 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NefmP08553 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefmP08553 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NefmP08553 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NefmP08553 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NefmP08553 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NefmP08553 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NefmP08553 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NefmP08553 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NefmP08553 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NefmP08553 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NefmP08553 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NefmP08553 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NefmP08553 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NefmP08553 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NefmP08553 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NefmP08553 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NefmP08553 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NefmP08553 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NefmP08553 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NefmP08553 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NefmP08553 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NefmP08553 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NefmP08553 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefmP08553 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefmP08553 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefmP08553 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefmP08553 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms