Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr1P08046 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr1P08046 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr1P08046 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr1P08046 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms