Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms