Protein–RNA interactions for Protein: P04942

Ig kappa chain V-VI region NQ5-61.1.2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04942 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04942 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04942 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04942 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04942 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04942 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04942 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms