Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-AaP01910 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms