Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01748 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01748 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01748 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01748 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01748 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01748 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01748 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01748 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms