Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01728 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01728 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01728 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01728 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01728 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01728 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01728 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01728 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01728 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01728 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01728 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01728 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01728 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01728 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms