Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01660 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01660 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01660 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01660 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01660 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01660 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01660 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01660 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01660 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01660 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01660 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01660 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01660 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01660 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01660 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01660 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01660 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01660 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms