Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pip4k2aO70172 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pip4k2aO70172 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms