Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChkbO55229 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChkbO55229 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChkbO55229 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChkbO55229 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChkbO55229 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChkbO55229 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChkbO55229 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms