Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6bO54951 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema6bO54951 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms