Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbieO54910 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NfkbieO54910 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NfkbieO54910 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfkbieO54910 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NfkbieO54910 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NfkbieO54910 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfkbieO54910 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbieO54910 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbieO54910 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbieO54910 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbieO54910 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbieO54910 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbieO54910 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbieO54910 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbieO54910 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NfkbieO54910 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfkbieO54910 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfkbieO54910 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NfkbieO54910 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NfkbieO54910 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NfkbieO54910 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfkbieO54910 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfkbieO54910 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbieO54910 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbieO54910 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbieO54910 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbieO54910 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbieO54910 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbieO54910 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbieO54910 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbieO54910 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms