Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp10aO54827 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp10aO54827 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp10aO54827 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms