Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EdaO54693 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EdaO54693 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EdaO54693 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EdaO54693 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EdaO54693 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EdaO54693 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EdaO54693 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EdaO54693 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EdaO54693 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EdaO54693 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EdaO54693 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EdaO54693 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EdaO54693 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EdaO54693 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EdaO54693 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EdaO54693 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EdaO54693 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EdaO54693 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EdaO54693 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EdaO54693 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EdaO54693 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EdaO54693 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EdaO54693 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EdaO54693 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EdaO54693 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EdaO54693 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EdaO54693 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EdaO54693 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EdaO54693 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EdaO54693 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EdaO54693 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EdaO54693 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EdaO54693 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EdaO54693 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EdaO54693 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms