Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Slc18a3O35304 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc18a3O35304 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms