Protein–RNA interactions for Protein: L7N476

Gm9611, Predicted gene 9611 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9611L7N476 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9611L7N476 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9611L7N476 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms